想要将三棱草除根可用人工清除的办法，不过此种方法只适合小面积，零星分布的，效果虽好，但费时费力。还可用化学药物防除，喷洒灭草灵。注意用量，大概每亩用25%的可湿性粉剂2.5-3.0公斤。另外，还可在采苗前处理土壤，插秧后三四天用毒土法用药，这样也可有效防除三棱草。