水稻田中的三棱草主要分为两个时期，其一是在水稻还未播种时，可以选择草甘膦喷施，根据三棱草的大小和抗性来增加用量。其二是在水稻播种之后，可使用二甲四氯、吡嘧磺隆、灭草松，也可以将丙草胺混上苄嘧磺隆，或者是使用二甲四氯加吡嘧磺隆，二甲四氯加灭草松，二甲四氯加氯氟吡氧乙酸来除根。