番茄绵腐病会危害幼苗和果实，会使果实脱落、烂光，因此在种植中，应起高畦，并且覆盖地膜，密度要合理，适量增施磷钾肥，加强排水及浇灌工作。发病后可以喷施甲霜灵粉剂或霜脲氰锰锌粉剂等农药的稀释液进行防治。