某些发生回肠炎的猪会继发如坏死杆菌、放线菌或类杆菌等的感染从而加剧病情，在慢性增生性病变的基础上发生炎症或坏死性病变。这种病型被称为坏死性增生性肠炎，其表现为体重严重下降并且经常持久性腹泻。剖检时可观察到在原有的回肠炎病变部分上重叠着凝集坏死并有明显的炎性渗出物。渗出物为黄灰色的干酪样团块，紧紧黏附于空肠-回肠黏膜上并且可能随着原发的增厚黏膜延伸。在深层组织检测到增生肠上皮细胞的残留物即可确认回肠炎引起的坏死性肠炎。