如果是一般纳税人取得高速公路通行费电子发票，进项税额是可以按3%计算抵扣的。

账务处理是，

借：管理费用—通行费，

应交税费—应交增值税（进项税额），

贷：银行存款等科目。

如果没有按规定取得高速公路通行费电子发票，进项税额就不能抵扣，只能计入费用抵扣企业所得税了。