鱼的呼吸主要依靠它的鳃，当水流从口中进入，经过鳃排出的时候，鳃丝内密布的微血管就会进行气体交换，从而获得氧气。不过除了鱼鳃之外，还有一些鱼类可通过辅助呼吸器官进行呼吸，有的可用皮肤呼吸，如弹涂鱼；有的则用肠道呼吸，如泥鳅；还有的用类似肺的鱼鳔呼吸，如非洲肺鱼。