果蝇属于节肢动物门。果蝇属于小型蝇类，体长1.5-4毫米间。虫体以黄褐色者居多，也有些是黑色的。头部有一对大而多呈鲜红色的复眼，两复眼内侧有三对眼缘刚毛，复眼间的后头中央微微隆起，形成一个单眼三角区，三个单眼的前下方生有一对单眼刚毛。