在人体排泄系统中，肾脏是制造尿液的地方，输尿管处在尿路的上游，尿道则是尿路的下游，可以将尿液排出体外。因此，除了以上因素外，女性生殖系统的各种疾病都有可能引起尿痛。

阴道感染

女性的尿道与阴道毗邻而居，细菌很容易侵入阴道，特别是在性交过后，“蜜月性膀胱炎”就是因此而得来的。女性阴道与肠道、肛门邻近，很多大肠细菌也会闯入阴道，引发尿路感染，导致尿痛。虽然女性尿路的表面上覆盖着一层像似保护膜的粘液层，在正常情况下，阴道粘膜会滋生一种乳酸杆菌，使阴道呈酸性，可以抑制细菌侵入。但这些自然防御功能因先天性缺乏或后天性改变时，容易引发阴道或尿路感染。

尿道炎

尿道炎直接影响排尿，其炎症细菌可在尿道扩散，是引起尿痛的主要因素之一。

宫颈内膜炎

女性宫颈内膜炎因宫颈有充血、水肿、触之易出血、黄色粘液脓性分泌物增多以及下腹部不适等，这些与尿道息息相关的部位，都是引起尿痛的因素。

非特异性阴道炎

非特异性阴道炎的主要症状是阴道上皮大量脱落，阴道粘膜充血，触痛明显，严重时出现全身乏力、小腹不适，白带量多、呈脓性或浆液性，白带外流刺激尿道口，严重引起尿痛。

霉菌性阴道炎

该症的突出症状是白带增多及外阴、阴道奇痒，阴道膜高度水肿，有白色片块状薄膜粘附，易剥离，此外受损粘膜的糜烂基底或形成浅溃疡等，刺激尿道，引发尿痛。

子宫肌瘤

这种常见于30～50岁的女性生殖器良性肿瘤，其症状是下腹部有肿块。这些肿块上的细菌可能随生殖道入侵尿道，引发尿痛。