1、主体不同。个人行贿罪的主体是自然人，其是一种钱权交易的对向性犯罪，即交易的主体双方具有对向性、同一性，在二者之间，一般不介入其他主体，因此，个人行贿罪具有两个核心要件：一是所谋取的不正当利益，必须是直接归属于自然人;二是所行贿的财物，必须是属于自然人所有、并归其支配。而单位行贿罪的犯罪主体必须是单位。
2、归向不同。单位行贿罪行贿行为的违法所得必须归单位所有，如果归个人所有，应以自然人的个人行贿罪论处。
3、情节标准不同。“情节严重”是构成单位行贿罪的必要条件之一，也是与个人行贿罪相区别的一个重要标志。至于如何认定该罪的“情节严重”，则应从主、客观两方面，即主观上的罪过程度与客观上造成的社会危害程度来确定，具有下列情形之一的应视为“情节严重”。自然人行贿十万元以上不满三十万元的属于“情节严重”，应判处五年以上十年以下有期徒刑，而单位行贿数额在二十万元以上的，才属于“情节严重”，的立案标准。