蜈蚣藻靠分裂孢子进行生殖（繁殖）。蜈蚣藻的孢丝细胞可以横裂或纵裂成更多的产孢丝细胞，同时生殖枝中的细胞也会进行分裂，并和附近的髓丝混杂围绕着产孢丝细胞形成球状或近球形的囊果，其末端具有一个小囊孔，产孢丝末端细胞会先形成孢子囊，它成熟后会从囊孔逸出。

温馨提示：蜈蚣属于野生保护动物（三有动物），保护野生动物从自身做起，拒绝买卖野生动物制品，不干扰野生动物的自由生活。目前社会上存在的食用珍贵、濒危野生动物等行为，既是一种社会陋习，也是非法猎捕、杀害珍贵、濒危野生动物活动屡禁不止的原因之一。没有买卖，就没有杀害，杜绝食用野生动物，它们不属于餐桌。