食用菌种植过程中，离不开菌种的配置，不同品种菌种配方有一定的差异。

草菇菌种配方：稻草30%、废棉50%、玉米粉17%、复合肥1%、石灰粉2%。木耳菌种配方：棉籽壳44%、木屑44%、麦麸10%、糖1%、石灰1%、石膏1%。平菇菌种配方：棉籽壳80%、稻草粉10%、麸皮8%、石灰2%。金针菇菌种配方：棉籽壳38%、麸皮32%、淋水陈积杂木屑25%、玉米粉3%、轻质碳酸钙0.5%。