高铁经过南京不下车行程码没有影响。根据国务院通信行程卡规则，行程卡记录个人行程城市，需在某城市停留超过4小时才会记录，如果途径时间短于4小时，则不会被记录。途经指在相关地区逗留过，包括乘坐汽车、火车经过中高风险地区内相关车站等且有上下客的，机场所在地为中高风险地区，且飞机在该机场起降过，均认为是“途经”。