鸭嘴兽吃一些小的水生动物，如昆虫的幼卵、虾米和蠕虫等。鸭嘴兽没有哺乳动物般尖利的牙齿，每次在水中逮到食物，先藏在腮帮子里，然后浮上水面，用嘴巴里的颌骨上下夹击后才大快朵颐。鸭嘴兽食量很大，每天所消耗食物与自身体重相等。