灵芝主要有6种品种，分别是赤灵芝、青灵芝、紫灵芝、黄灵芝、白灵芝和黑灵芝等。

1、赤灵芝：又名丹芝，呈木栓质，菌盖呈肾形或者半圆形。表面呈红褐色，有光泽，菌柄的颜色一般较深。

2、青灵芝：又称灵芝草、神芝、芝草、仙草、瑞草，是多孔菌科植物赤芝或紫芝的全株。

3、紫灵芝：是灵芝科、灵芝属真菌。担子果一年生，有柄。菌盖半圆形、近圆形或近匙形，表面紫褐色、紫黑色到近黑色。

4、黄灵芝：又名金芝，是担子果一年生，无柄，木栓质到木质。菌盖龟裂状，近圆形，表面有褐色和土黄褐色相间的宽环棱和环带，稍有似漆样光泽。

5、白灵芝：又名玉芝，主要生长于较湿润的山林中，菌肉洁白，味奇苦，为灵芝罕见品种，主要分布于黑龙江乌苏里江流域饶河自然保护区，云南省、西藏自治区以及长白山区。