以下为南京农业大学2020年硕士研究生招生收费标准，仅供参考：
| 类别 | 专业 | 收费标准 |
| 全日制学术学位硕士 | 全部专业 | 8000元/生.学年（3年共24000） |
| 全日制专业学位硕士 | 农业硕士 | 8000元/生.学年（2年共16000） |
| 兽医硕士 | ||
| 中药学硕士 | ||
| 风景园林硕士 | 10000元/生.学年（2年共20000） | |
| 社会工作硕士 | ||
| 工程硕士 | ||
| 金融硕士 | ||
| 国际商务硕士 | ||
| 翻译硕士 | ||
| 物流工程与管理硕士 | ||
| 图书情报硕士 | ||
| 会计硕士MPAcc | 25000元/生.学年（2年共50000） | |
| 非全日制专业学位硕士 | 兽医硕士 | 10000元/生.学年（3年共30000） |
| 工商管理硕士MBA | 46000元/生.学年（2年共92000） | |
| 公共管理硕士MPA | 20000/生.学年（3年共60000） | |
| 会计硕士MPAcc | 37500元/生.学年（2年共75000） |
