1、复旦大学医学院（原上海医科大学并入的）， 位于上海市浦东新区张衡路，复旦大学上海医学院（原上海医科大学）创建于1927年，创立时名为国立第四中山大学医学院，是中国人创办的第一所国立大学医学院，颜福庆出任首任院长。1932年，独立为国立上海医学院（简称上医），院训是“正谊明道”，出自《汉书·董仲舒传》：正其谊不谋其利，明其道不计其功，1939年，因抗战爆发内迁至云南昆明。1940年，辗转迁至四川重庆，1946年，抗战胜利，迁回上海。1952年，更名为“上海第一医学院”，1959年，被定为全国16所重点高等学府之一。

2、交大医学院（原上海第二医科大学并入的）， 位于上海市黄浦区重庆南路227号，上海交通大学医学院位于创新求索、文化荟萃、包容并蓄的黄浦腹地，红墙映日、梧桐环绕。其前身是由圣约翰大学医学院(1896-1952)、震旦大学医学院(1911-1952)、同德医学院（1918-1952)于1952年全国高等学校院系调整时合并而成的上海第二医学院，1985年更名为上海第二医科大学。1997年，学校通过了“211工程”立项。2005年7月，上海交通大学与上海第二医科大学合并，成立了新的由教育部、上海市政府重点共建的上海交通大学医学院，进入“985”高校行列。

3、同济大学医学院，位于上海市普陀区真南路500号同济大学沪西校区天佑楼，同济大学的医学教育源远流长。1907年成立的德文医学堂是同济医学专业的开端，也是同济大学的雏形。历经百年沧桑，在新世纪之初，医学重新扎根于同济大学，在原上海铁道大学医学院的基础上，成立了同济大学医学院，此后同济大学的医学专业成为重点建设的学科，走上复兴之路。

4、上海中医药大学，位于上海市浦东新区蔡伦路1200号，1993年上海中医学院更名为上海中医药大学，2000年合并原上海医学高等专科学校，2003年学校整体搬迁至浦东张江高科技园区，已成为张江药谷的重要组成部分。