微信商家版和个人的区别在于商户收款码使用的范围更广，个人收款码一般在流动摊位或者个人小便利店用的比较多，相当于转账功能。个人版手续费低，个人版有收款限制，个人版不支持信用卡付款。商户版可以管理多加店铺，可以免费使用微信买单小程序。