数据库系统与文件系统的本质区别主要在于：

1、文件系统用文件将数据长期保存在外存上，数据库系统用数据库统一存储数据；

2、文件系统中的程序和数据有一定的联系，数据库系统中的程序和数据分离；

3、文件系统用操作系统中的存取方法对数据进行管理，数据库系统用DBMS统一管理和控制数据；

4、文件系统实现以文件为单位的数据共享，数据库系统实现以记录和字段为单位的数据共享。

文件系统和数据库系统之间的联系：

1、均为数据组织的管理技术；

2、均由数据管理软件管理数据，程序与数据之间用存取方法进行转换；